Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK1P57059 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK1P57059 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK1P57059 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK1P57059 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK1P57059 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK1P57059 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK1P57059 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms