Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAG2P55895 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAG2P55895 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RAG2P55895 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAG2P55895 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms