Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms