Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms