Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPAP53621 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPAP53621 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPAP53621 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPAP53621 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
COPAP53621 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPAP53621 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPAP53621 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPAP53621 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms