Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms