Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBP50607 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBP50607 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBP50607 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBP50607 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBP50607 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBP50607 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBP50607 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBP50607 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBP50607 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBP50607 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBP50607 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms