Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GSK3BP49841 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms