Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms