Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT3P49368 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCT3P49368 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCT3P49368 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCT3P49368 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCT3P49368 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCT3P49368 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCT3P49368 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms