Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A6P48664 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A6P48664 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms