Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TM4SF4P48230 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms