Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP5P45974 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP5P45974 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP5P45974 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP5P45974 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP5P45974 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms