Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms