Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRATP43155 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRATP43155 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRATP43155 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRATP43155 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRATP43155 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms