Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCAPD3P42695 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms