Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA3P42263 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms