Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms