Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPGP40121 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPGP40121 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAPGP40121 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms