Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms