Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGCXP38435 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGCXP38435 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms