Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms