Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL4P36578 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms