Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP1P32455 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP1P32455 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP1P32455 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP1P32455 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP1P32455 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP1P32455 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP1P32455 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms