Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC9P31274 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms