Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA10P31260 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms