Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD34P28906 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD34P28906 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD34P28906 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD34P28906 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms