Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCAP28676 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCAP28676 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCAP28676 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCAP28676 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCAP28676 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCAP28676 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCAP28676 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCAP28676 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms