Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX2P28328 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX2P28328 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX2P28328 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX2P28328 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms