Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4AP27815 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4AP27815 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms