Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms