Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2AP24928 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms