Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA1P20827 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms