Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCP1P17987 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCP1P17987 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms