Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms