Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF4P15884 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF4P15884 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF4P15884 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF4P15884 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF4P15884 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF4P15884 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF4P15884 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF4P15884 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF4P15884 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF4P15884 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms