Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME1P15531 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME1P15531 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME1P15531 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME1P15531 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME1P15531 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME1P15531 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME1P15531 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME1P15531 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME1P15531 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms