Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms