Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFITM1P13164 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFITM1P13164 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms