Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP2C9P11712 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms