Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RARBP10826 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RARBP10826 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARBP10826 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARBP10826 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARBP10826 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARBP10826 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARBP10826 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms