Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms