Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4AP0C0L4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms