Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOP08100 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOP08100 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOP08100 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOP08100 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOP08100 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHOP08100 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms