Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms