Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFMP07197 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFMP07197 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms