Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDN1P05305 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDN1P05305 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDN1P05305 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDN1P05305 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDN1P05305 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDN1P05305 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDN1P05305 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDN1P05305 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDN1P05305 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDN1P05305 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDN1P05305 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms