Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms