Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NSD2O96028 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSD2O96028 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSD2O96028 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms