Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX7O95931 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms